全国卷一和新高考卷一的区别体现在选科模式、出题机构、考试方式、影响范围等方面。
1、选科模式不同
全国卷总分750分，分文科和理科，其中语数外三科每门150分，文科的数学试卷难度低一些，加上文科综合300分，总计750分。使用全国卷一的省市都是高考大省：河南、安徽、江西、山西等。
新高考“3+3”总分750分，采用3+3新考试改革，高考科目3+3，共包括6科。其中3科统考科目：语文、数学、外语，各科满分分值为150分，不分文理科。
另外的3科选考科目即等级考试科目。实行6选3政策：即考生从思想政治、历史、地理、物理、化学、生物6科中选3科。选科组合共有20种，作为选考科目，均以等级赋分形式计入高考总分。采用该套卷子的只有山东一个省份。
2、出题机构不同
新高考卷由各省份自主命题，考试内容和难度根据当地教育教学特点和需求进行调整。而全国卷由教育部组织命题，考试内容和难度在全国范围内保持一致。
3、考试方式不同新高考卷的考试方式是多元化的评价方式，主要包括学业水平测试成绩、综合素质评价、加分项评价等多种因素。而全国卷则主要依据学业水平测试成绩进行评价。
4、影响范围不同
新高考卷主要是针对各省份的高考招生进行改革，只在各省份内部实行。而全国卷则是为了保证全国高考的公平、公正，每年都会组织命题并且统一评卷，成绩对于全国高校的招生都有影响，这些省份教育水平相对比较发达，参加高考的人数也比较多，高考的压力也最大。